Как исправить в R: неверный факторный уровень, создано NA

Одно предупреждающее сообщение, с которым вы можете столкнуться при использовании R:

Warning message:
In `[<-.factor`(`\*tmp\*`, iseq, value = "C") :
 invalid factor level, NA generated

Это предупреждение появляется, когда вы пытаетесь добавить значение к факторной переменной в R, которая еще не существует как определенный уровень.

В следующем примере показано, как устранить это предупреждение на практике.

Как воспроизвести предупреждение

Предположим, у нас есть следующий фрейм данных в R:

#create data frame
df <- data.frame(team=factor(c('A', 'A', 'B', 'B', 'B')),
 points=c(99, 90, 86, 88, 95))

#view data frame
df

 team points
1 A 99
2 A 90
3 B 86
4 B 88
5 B 95

#view structure of data frame
str(df)

'data.frame': 5 obs. of 2 variables:
 $ team : Factor w/ 2 levels "A","B": 1 1 2 2 2
 $ points: num 99 90 86 88 95

Мы видим, что переменная team представляет собой фактор с двумя уровнями: «A» и «B».

Теперь предположим, что мы пытаемся добавить новую строку в конец фрейма данных, используя значение «C» для команды :

#add new row to end of data frame
df[nrow(df) + 1,] = c('C', 100)

Warning message:
In `[<-.factor`(`\*tmp\*`, iseq, value = "C") :
 invalid factor level, NA generated

Мы получаем предупреждающее сообщение, потому что значение «C» еще не существует в качестве уровня фактора для переменной команды .

Важно отметить, что это просто предупреждающее сообщение, и R по-прежнему добавит новую строку в конец фрейма данных, но будет использовать значение NA вместо «C»:

#view updated data frame
df

 team points
1 A 99
2 A 90
3 B 86
4 B 88
5 B 95
6 NA 100

Как избежать предупреждения

Чтобы избежать предупреждения о недопустимом уровне фактора , мы должны сначала преобразовать переменную фактора в символьную переменную, а затем мы можем преобразовать ее обратно в переменную фактора после добавления новой строки:

#convert team variable to character
df$team <- as. character (df$team)

#add new row to end of data frame
df[nrow(df) + 1,] = c('C', 100)

#convert team variable back to factor
df$team <- as. factor (df$team)

#view updated data frame
df

 team points
1 A 99
2 A 90
3 B 86
4 B 88
5 B 95
6 C 100

Обратите внимание, что мы можем успешно добавить новую строку в конец фрейма данных и избежать предупреждающего сообщения.

Мы также можем проверить, что значение «C» было добавлено в качестве уровня фактора к переменной team :

#view structure of updated data frame
str(df)

'data.frame': 6 obs. of 2 variables:
 $ team : Factor w/ 3 levels "A","B","C": 1 1 2 2 2 3
 $ points: chr "99" "90" "86" "88" ...

Дополнительные ресурсы

В следующих руководствах объясняется, как исправить другие распространенные ошибки в R:

Как исправить в R: аргументы подразумевают разное количество строк
Как исправить в R: ошибка выбора неиспользуемых аргументов
Как исправить в R: замена имеет нулевую длину