Как выполнить U-тест Манна-Уитни в R


U-критерий Манна-Уитни (иногда называемый критерием суммы рангов Уилкоксона) используется для сравнения различий между двумя независимыми выборками, когда распределение выборки не является нормальным, а размеры выборки малы (n < 30).

Он считается непараметрическим эквивалентом двухвыборочного независимого t-критерия .

В этом руководстве объясняется, как выполнить U-критерий Манна-Уитни в R.

Пример: U-критерий Манна-Уитни в R

Исследователи хотят знать, эффективен ли новый препарат для предотвращения приступов паники. В общей сложности 12 пациентов были случайным образом разделены на две группы по 6 человек и назначены для получения нового препарата или плацебо. Затем пациенты записывают, сколько приступов паники у них было в течение одного месяца.

Результаты показаны ниже:

| НОВЫЙ ПРЕПАРАТ | плацебо | | --- | --- | | 3 | 4 | | 5 | 8 | | 1 | 6 | | 4 | 2 | | 3 | 1 | | 5 | 9 |

Проведите U-критерий Манна-Уитни, чтобы определить, есть ли разница в количестве панических атак у пациентов в группе плацебо по сравнению с группой нового препарата. Используйте уровень значимости 0,05.

Существует два разных способа выполнения U-критерия Манна-Уитни, но оба метода используют функцию wilcox.test() и оба приводят к одному и тому же результату.

Вариант 1: введите данные в виде двух отдельных векторов.

#create a vector for each group
new <- c(3, 5, 1, 4, 3, 5)
placebo <- c(4, 8, 6, 2, 1, 9)

#perform the Mann Whitney U test
wilcox.test(new, placebo)

#output
Wilcoxon rank sum test with continuity correction

data: new and placebo
W = 13, p-value = 0.468
alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0

Вариант 2: введите данные в один фрейм данных с двумя столбцами. В одном столбце указано количество панических атак, а в другом — группа.

#create a data frame with two columns, one for each group
drug_data <- data.frame(attacks = c(3, 5, 1, 4, 3, 5, 4, 8, 6, 2, 1, 9),
 drug_group = c(rep("old", 6), rep("placebo", 6)))

#perform the Mann Whitney U test
wilcox.test(attacks~drug_group, data = drug_data)

#output
data: attacks by drug_group
W = 13, p-value = 0.468
alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0

Обратите внимание, что оба метода приводят к одному и тому же результату. А именно, тестовая статистика равна W = 13, а соответствующее значение p равно 0,468 .

Поскольку p-значение больше 0,05, мы не можем отвергнуть нулевую гипотезу.

Это означает, что у нас нет достаточных доказательств, чтобы сказать, что количество приступов паники, испытанных пациентами в группе плацебо, отличается от группы нового препарата.

Примечания по использованию Wilcox.test()

По умолчанию wilcox.test() предполагает, что вы хотите запустить двустороннюю проверку гипотезы. Однако вы можете указать альтернативу = «меньше» или альтернативу = «больше» , если вместо этого хотите запустить односторонний тест.

Например, предположим, что мы хотим проверить гипотезу о том, что новый препарат вызывает меньше приступов паники, чем плацебо. В этом случае мы могли бы указать альтернативу = «less» в нашей функции wilkox.test():

#create a vector for each group
new <- c(3, 5, 1, 4, 3, 5)
placebo <- c(4, 8, 6, 2, 1, 9)

#perform the Mann Whitney U test, specify alternative="less"
wilcox.test(new, placebo, alternative="less")

#output
 Wilcoxon rank sum test with continuity correction

data: new and placebo
W = 13, p-value = 0.234
alternative hypothesis: true location shift is less than 0

Обратите внимание, что статистика теста по-прежнему W = 13, но значение p теперь равно 0,234 , что ровно вдвое меньше, чем предыдущее значение p для двустороннего теста.

Поскольку p-значение все еще больше 0,05, мы все равно не сможем отвергнуть нулевую гипотезу.

У нас нет достаточных доказательств, чтобы сказать, что количество приступов паники, испытанных пациентами в группе нового препарата, было меньше, чем у пациентов в группе плацебо.

Дополнительные ресурсы

Руководство по U-тесту Манна-Уитни
Калькулятор критерия Манна-Уитни U

Замечательно! Вы успешно подписались.
Добро пожаловать обратно! Вы успешно вошли
Вы успешно подписались на кодкамп.
Срок действия вашей ссылки истек.
Ура! Проверьте свою электронную почту на наличие волшебной ссылки для входа.
Успех! Ваша платежная информация обновлена.
Ваша платежная информация не была обновлена.